<commit_before><?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="no"?>
<launchConfiguration type="org.eclipse.pde.ui.RuntimeWorkbench">
<booleanAttribute key="append.args" value="true"/>
<booleanAttribute key="askclear" value="false"/>
<booleanAttribute key="automaticAdd" value="true"/>
<booleanAttribute key="automaticValidate" value="true"/>
<stringAttribute key="bootstrap" value=""/>
<stringAttribute key="checked" value="[NONE]"/>
<booleanAttribute key="clearConfig" value="true"/>
<booleanAttribute key="clearws" value="true"/>
<booleanAttribute key="clearwslog" value="false"/>
<stringAttribute key="configLocation" value="${workspace_loc}/.metadata/.plugins/org.eclipse.pde.core/Caleydo"/>
<booleanAttribute key="default" value="false"/>
<booleanAttribute key="includeOptional" value="true"/>
<stringAttribute key="location" value="${workspace_loc}/runtime-org.caleydo.product"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.debug.core.appendEnvironmentVariables" value="true"/>
<mapAttribute key="org.eclipse.debug.core.environmentVariables">
<mapEntry key="LD_LIBRARY_PATH" value="/usr/lib/R/lib:/usr/lib/R/bin"/>
<mapEntry key="R_HOME" value="/usr/lib/R"/>
</mapAttribute>
<listAttribute key="org.eclipse.debug.ui.favoriteGroups">
<listEntry value="org.eclipse.debug.ui.launchGroup.debug"/>
</listAttribute>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_AUTO_FILTER_CRITERIA" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_AUTO_MONITORING" value="true"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DATA_COLLECTOR" value="org.eclipse.tptp.trace.jvmti.jvmtiMechanism:org.eclipse.tptp.analysisType.jvmti.execution"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_FILE" value=""/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_MONITOR" value="DefaultMonitor"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_PROJECT" value="ProfileProject"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_PROFILE_TO_FILE" value="false"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_PROFILING_SET" value="tptp-dummy-profiling-set-Caleydo RCP"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.PROGRAM_ARGUMENTS" value="-os ${target.os} -ws ${target.ws} -arch ${target.arch} -nl ${target.nl} -consoleLog -data @noDefault"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.SOURCE_PATH_PROVIDER" value="org.eclipse.pde.ui.workbenchClasspathProvider"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.VM_ARGUMENTS" value="-Xms512m -Xmx1024m -Djava.util.logging.config.file=data/logging/logging.properties -Xss16384k"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.WORKING_DIRECTORY" value="${workspace_loc:org.caleydo.data}"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_AUTO_POLLING" value="true"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_CPU_TIME" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_FLOW" value="true"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_MANUAL_POLLING" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_OBJ_ALLOC_SITE" value="true"/>
<intAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_POLLING_TIME" value="60"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_FILTERSET_ID" value="org.eclipse.hyades.trace.ui.Caleydo Filter Settings1265641044643"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_HEAP_COLLECT_INSTANCE" value="true"/>
<stringAttribute key="pde.version" value="3.3"/>
<stringAttribute key="product" value="org.caleydo.core.product"/>
<stringAttribute key="productFile" value="/org.caleydo.rcp/org.caleydo.rcp.product"/>
<booleanAttribute key="restart" value="false"/>
<stringAttribute key="selected_target_plugins" value="com.ibm.icu@default:default,javax.servlet@default:default,org.eclipse.ant.core@default:default,org.eclipse.core.commands@default:default,org.eclipse.core.contenttype@default:default,org.eclipse.core.databinding.observable@default:default,org.eclipse.core.databinding.property@default:default,org.eclipse.core.databinding@default:default,org.eclipse.core.expressions@default:default,org.eclipse.core.filesystem.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.core.filesystem@default:default,org.eclipse.core.jobs@default:default,org.eclipse.core.net.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.core.net@default:default,org.eclipse.core.resources@default:default,org.eclipse.core.runtime.compatibility.auth@default:default,org.eclipse.core.runtime.compatibility.registry@default:false,org.eclipse.core.runtime@default:true,org.eclipse.core.variables@default:default,org.eclipse.ecf.filetransfer@default:default,org.eclipse.ecf.identity@default:default,org.eclipse.ecf.provider.filetransfer.ssl@default:false,org.eclipse.ecf.provider.filetransfer@default:default,org.eclipse.ecf.ssl@default:false,org.eclipse.ecf@default:default,org.eclipse.equinox.app@default:default,org.eclipse.equinox.common@2:true,org.eclipse.equinox.concurrent@default:default,org.eclipse.equinox.p2.core@default:default,org.eclipse.equinox.p2.engine@default:default,org.eclipse.equinox.p2.metadata.repository@default:default,org.eclipse.equinox.p2.metadata@default:default,org.eclipse.equinox.p2.repository@default:default,org.eclipse.equinox.preferences@default:default,org.eclipse.equinox.registry@default:default,org.eclipse.equinox.security@default:default,org.eclipse.help@default:default,org.eclipse.jface.databinding@default:default,org.eclipse.jface.text@default:default,org.eclipse.jface@default:default,org.eclipse.osgi.services@default:default,org.eclipse.osgi@-1:true,org.eclipse.rcp@default:default,org.eclipse.swt.gtk.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.swt@default:default,org.eclipse.text@default:default,org.eclipse.ui.forms@default:default,org.eclipse.ui.ide@default:default,org.eclipse.ui.views.log@default:default,org.eclipse.ui.views@default:default,org.eclipse.ui.workbench@default:default,org.eclipse.ui@default:default"/>
<stringAttribute key="selected_workspace_plugins" value="org.caleydo.core@default:default,org.caleydo.data.importer.tcga@default:default,org.caleydo.data.pathway.biocarta@default:default,org.caleydo.data.pathway.kegg@default:default,org.caleydo.data@default:default,org.caleydo.datadomain.clinical@default:default,org.caleydo.datadomain.generic@default:default,org.caleydo.datadomain.genetic@default:default,org.caleydo.datadomain.pathway@default:default,org.caleydo.datadomain.tissue@default:default,org.caleydo.lib.core@default:default,org.caleydo.lib.jogl@default:default,org.caleydo.musama@default:default,org.caleydo.util.gleem@default:default,org.caleydo.util.graph@default:default,org.caleydo.view.bookmark@default:default,org.caleydo.view.browser@default:default,org.caleydo.view.bucket@default:default,org.caleydo.view.dataflipper@default:default,org.caleydo.view.datagraph@default:default,org.caleydo.view.datameta@default:default,org.caleydo.view.datawindows@default:default,org.caleydo.view.filter@default:default,org.caleydo.view.filterpipeline@default:default,org.caleydo.view.genesearch@default:default,org.caleydo.view.grouper@default:default,org.caleydo.view.heatmap@default:default,org.caleydo.view.histogram@default:default,org.caleydo.view.info@default:default,org.caleydo.view.matchmaker@default:default,org.caleydo.view.parcoords@default:default,org.caleydo.view.pathway@default:default,org.caleydo.view.pathwaybrowser@default:default,org.caleydo.view.radial@default:default,org.caleydo.view.scatterplot@default:default,org.caleydo.view.selectionbrowser@default:default,org.caleydo.view.tabular@default:default,org.caleydo.view.tagclouds@default:default,org.caleydo.view.template@default:default,org.caleydo.view.texture@default:default,org.caleydo.view.tissuebrowser@default:default,org.caleydo.view.treemap@default:default,org.caleydo.view.visbricks@default:default"/>
<booleanAttribute key="show_selected_only" value="false"/>
<booleanAttribute key="tracing" value="false"/>
<booleanAttribute key="useCustomFeatures" value="false"/>
<booleanAttribute key="useDefaultConfig" value="true"/>
<booleanAttribute key="useDefaultConfigArea" value="true"/>
<booleanAttribute key="useProduct" value="true"/>
<booleanAttribute key="usefeatures" value="false"/>
</launchConfiguration>
<commit_msg>forgot to commit linux run config.<commit_after><?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="no"?>
<launchConfiguration type="org.eclipse.pde.ui.RuntimeWorkbench">
<booleanAttribute key="append.args" value="true"/>
<booleanAttribute key="askclear" value="false"/>
<booleanAttribute key="automaticAdd" value="true"/>
<booleanAttribute key="automaticValidate" value="true"/>
<stringAttribute key="bootstrap" value=""/>
<stringAttribute key="checked" value="[NONE]"/>
<booleanAttribute key="clearConfig" value="true"/>
<booleanAttribute key="clearws" value="true"/>
<booleanAttribute key="clearwslog" value="false"/>
<stringAttribute key="configLocation" value="${workspace_loc}/.metadata/.plugins/org.eclipse.pde.core/Caleydo"/>
<booleanAttribute key="default" value="false"/>
<booleanAttribute key="includeOptional" value="true"/>
<stringAttribute key="location" value="${workspace_loc}/runtime-org.caleydo.product"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.debug.core.appendEnvironmentVariables" value="true"/>
<mapAttribute key="org.eclipse.debug.core.environmentVariables">
<mapEntry key="LD_LIBRARY_PATH" value="/usr/lib/R/lib:/usr/lib/R/bin"/>
<mapEntry key="R_HOME" value="/usr/lib/R"/>
</mapAttribute>
<listAttribute key="org.eclipse.debug.ui.favoriteGroups">
<listEntry value="org.eclipse.debug.ui.launchGroup.debug"/>
</listAttribute>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_AUTO_FILTER_CRITERIA" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_AUTO_MONITORING" value="true"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DATA_COLLECTOR" value="org.eclipse.tptp.trace.jvmti.jvmtiMechanism:org.eclipse.tptp.analysisType.jvmti.execution"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_FILE" value=""/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_MONITOR" value="DefaultMonitor"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_DESTINATION_PROJECT" value="ProfileProject"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_PROFILE_TO_FILE" value="false"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.hyades.trace.ui.ATTR_PROFILING_SET" value="tptp-dummy-profiling-set-Caleydo RCP"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.PROGRAM_ARGUMENTS" value="-os ${target.os} -ws ${target.ws} -arch ${target.arch} -nl ${target.nl} -consoleLog -data @noDefault"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.SOURCE_PATH_PROVIDER" value="org.eclipse.pde.ui.workbenchClasspathProvider"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.VM_ARGUMENTS" value="-Xms512m -Xmx1024m -Djava.util.logging.config.file=data/logging/logging.properties -Xss16384k"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.WORKING_DIRECTORY" value="${workspace_loc:org.caleydo.data}"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_AUTO_POLLING" value="true"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_CPU_TIME" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_FLOW" value="true"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_MANUAL_POLLING" value="false"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_OBJ_ALLOC_SITE" value="true"/>
<intAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_EXEC_POLLING_TIME" value="60"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_FILTERSET_ID" value="org.eclipse.hyades.trace.ui.Caleydo Filter Settings1265641044643"/>
<booleanAttribute key="org.eclipse.tptp.platform.jvmti.client.ATTR_HEAP_COLLECT_INSTANCE" value="true"/>
<stringAttribute key="pde.version" value="3.3"/>
<stringAttribute key="product" value="org.caleydo.core.product"/>
<stringAttribute key="productFile" value="/org.caleydo.rcp/org.caleydo.rcp.product"/>
<booleanAttribute key="restart" value="false"/>
<stringAttribute key="selected_target_plugins" value="com.ibm.icu@default:default,javax.servlet@default:default,org.eclipse.ant.core@default:default,org.eclipse.core.commands@default:default,org.eclipse.core.contenttype@default:default,org.eclipse.core.databinding.observable@default:default,org.eclipse.core.databinding.property@default:default,org.eclipse.core.databinding@default:default,org.eclipse.core.expressions@default:default,org.eclipse.core.filesystem.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.core.filesystem@default:default,org.eclipse.core.jobs@default:default,org.eclipse.core.net.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.core.net@default:default,org.eclipse.core.resources@default:default,org.eclipse.core.runtime.compatibility.auth@default:default,org.eclipse.core.runtime.compatibility.registry@default:false,org.eclipse.core.runtime@default:true,org.eclipse.core.variables@default:default,org.eclipse.ecf.filetransfer@default:default,org.eclipse.ecf.identity@default:default,org.eclipse.ecf.provider.filetransfer.ssl@default:false,org.eclipse.ecf.provider.filetransfer@default:default,org.eclipse.ecf.ssl@default:false,org.eclipse.ecf@default:default,org.eclipse.equinox.app@default:default,org.eclipse.equinox.common@2:true,org.eclipse.equinox.concurrent@default:default,org.eclipse.equinox.p2.core@default:default,org.eclipse.equinox.p2.engine@default:default,org.eclipse.equinox.p2.metadata.repository@default:default,org.eclipse.equinox.p2.metadata@default:default,org.eclipse.equinox.p2.repository@default:default,org.eclipse.equinox.preferences@default:default,org.eclipse.equinox.registry@default:default,org.eclipse.equinox.security@default:default,org.eclipse.help@default:default,org.eclipse.jface.databinding@default:default,org.eclipse.jface.text@default:default,org.eclipse.jface@default:default,org.eclipse.osgi.services@default:default,org.eclipse.osgi@-1:true,org.eclipse.rcp@default:default,org.eclipse.swt.gtk.linux.x86_64@default:false,org.eclipse.swt@default:default,org.eclipse.text@default:default,org.eclipse.ui.forms@default:default,org.eclipse.ui.ide@default:default,org.eclipse.ui.views.log@default:default,org.eclipse.ui.views@default:default,org.eclipse.ui.workbench@default:default,org.eclipse.ui@default:default"/>
<stringAttribute key="selected_workspace_plugins" value="org.caleydo.core@default:default,org.caleydo.data.importer.tcga@default:default,org.caleydo.data.pathway.biocarta@default:default,org.caleydo.data.pathway.kegg@default:default,org.caleydo.data@default:default,org.caleydo.datadomain.clinical@default:default,org.caleydo.datadomain.generic@default:default,org.caleydo.datadomain.genetic@default:default,org.caleydo.datadomain.pathway@default:default,org.caleydo.datadomain.tissue@default:default,org.caleydo.lib.core@default:default,org.caleydo.lib.jogl@default:default,org.caleydo.musama@default:default,org.caleydo.util.gleem@default:default,org.caleydo.util.graph@default:default,org.caleydo.util.r@default:default,org.caleydo.view.bookmark@default:default,org.caleydo.view.browser@default:default,org.caleydo.view.bucket@default:default,org.caleydo.view.dataflipper@default:default,org.caleydo.view.datagraph@default:default,org.caleydo.view.datameta@default:default,org.caleydo.view.datawindows@default:default,org.caleydo.view.filter@default:default,org.caleydo.view.filterpipeline@default:default,org.caleydo.view.genesearch@default:default,org.caleydo.view.grouper@default:default,org.caleydo.view.heatmap@default:default,org.caleydo.view.histogram@default:default,org.caleydo.view.info@default:default,org.caleydo.view.matchmaker@default:default,org.caleydo.view.parcoords@default:default,org.caleydo.view.pathway@default:default,org.caleydo.view.pathwaybrowser@default:default,org.caleydo.view.radial@default:default,org.caleydo.view.scatterplot@default:default,org.caleydo.view.selectionbrowser@default:default,org.caleydo.view.tabular@default:default,org.caleydo.view.tagclouds@default:default,org.caleydo.view.template@default:default,org.caleydo.view.texture@default:default,org.caleydo.view.tissuebrowser@default:default,org.caleydo.view.treemap@default:default,org.caleydo.view.visbricks@default:default"/>
<booleanAttribute key="show_selected_only" value="false"/>
<booleanAttribute key="tracing" value="false"/>
<booleanAttribute key="useCustomFeatures" value="false"/>
<booleanAttribute key="useDefaultConfig" value="true"/>
<booleanAttribute key="useDefaultConfigArea" value="true"/>
<booleanAttribute key="useProduct" value="true"/>
<booleanAttribute key="usefeatures" value="false"/>
</launchConfiguration>

{'fraction_non_alphanumeric': 0.15509067203982457, 'fraction_numerical': 0.006044802654972146, 'mean_word_length': 10.355989232839839, 'pattern_counts': {'":': 0, '<': 117, '<?xml version=': 2, '>': 117, 'https://': 0, 'lorem ipsum': 0, 'www.': 0, 'xml': 2}, 'pii_count': 0, 'substrings_counts': 0, 'word_list_counts': {'cursed_substrings.json': 0, 'profanity_word_list.json': 0, 'sexual_word_list.json': 0, 'zh_pornsignals.json': 0}}
{'dir': 'git-commits-cleaned', 'id': '6438840', 'n_tokens_mistral': 5781, 'n_tokens_neox': 5576, 'n_words': 361}