env = {}
env.update(os.environ)
env.update(source('~/scripts/mySetUpFreeSurfer.sh'))
env.update(source('/usr/local/freesurfer/FreeSurferEnv.sh'))
check_output(cmd, shell=True, env=env)
как сделать так, чтобы подпроцесс, вызываемый с помощью call/Popen, наследовал переменные окружения