Base = declarative_base()


class A(Base):
    __tablename__ = 'a'
id = Column(Integer, primary_key=True)
data = Column(String(20))
boolean = Column(Boolean)
e = create_engine('sqlite://', echo=True)
Base.metadata.create_all(e)
s = Session(e)
s.add_all([A(data='a1', boolean=True), A(data='a2', boolean=False), A(data=
    'a3', boolean=True)])
print(s.query(A).filter(A.data > 'a1', A.boolean).all())
print(s.query(A).filter(A.boolean).all())
Столбец логического типа как ClauseElement в SQLAlchemy