with open('input.yaml', 'r') as fi:
    data = ruamel.yaml.round_trip_load(fi)
walk_tree(data)
with open('output.yaml', 'w') as fo:
    ruamel.yaml.round_trip_dump(data, fo)
Преобразуйте многострочные значения YAML в скалярный стиль свернутого блока, используя