queries = (
    """
SELECT ColumnX_1, ColumnX_2, ColumnX_3
FROM Table_X
INNER JOIN (Etc etc...)
---
SELECT ColumnY_1, ColumnY_2, ColumnY_3
FROM Table_Y
INNER JOIN (Etc etc...)
"""
    .split('---'))
Запрос Pandas read_sql с несколькими выборками