output = """<!DOCTYPE html>
<html lang="en">
<head>
    <meta charset="utf-8">
    <style type="text/css">
"""
cssin = open(sys.argv[2])
output += cssin.read()
output += """
    </style>
</head>
<body>
"""
mkin = open(sys.argv[1])
output += markdown2.markdown(mkin.read())
уценка в html с использованием указанного css