f1 = h5py.File(file_name, 'r+')
data = f1['meas/frame1/data']
data[...] = X1
f1.close()
f1 = h5py.File(file_name, 'r')
np.allclose(f1['meas/frame1/data'].value, X1)
Как перезаписать массив внутри файла h5 с помощью h5py