check_call(
    """
{ 
samtools view -HS header.sam;           
samtools view input.bam 1:1-50000000;   
} | samtools view -bS - > output.bam    
"""
    , shell=True)
Как присоединиться к стандартному выводу двух подпроцессов и подключиться к стандартному вводу нового подпроцесса в python