ds1 = set([tuple(values) for values in df1.values.tolist()])
ds2 = set([tuple(values) for values in df2.values.tolist()])
ds1.symmetric_difference(ds2)
print(df1, '\n\n')
print(df2, '\n\n')
print(pd.DataFrame(list(ds1.difference(ds2))), '\n\n')
print(pd.DataFrame(list(ds2.difference(ds1))), '\n\n')
Сравните два файла csv с пандами python