如何确定两个生物序列的相似性?
确定DNA字符串等两个生物序列之间的相似性的一种常见方法是通过序列对齐.这是以达到字符之间的最大对齐的方式安排两个或多个序列的过程.在这个过程中,将差距引入序列中,以考虑遗传材料的插入,删除或重复.一个流行的序列对齐算法是Needleman-Wunsch算法,它使用动态编程来找到两个序列之间的最佳全球对齐.该算法通过考虑每个序列的不同对齐,并根据其相似性给每个序列分配分数来工作.与最高分数的对齐被认为是最佳匹配.其他方法可以包括 BLAST (本地对齐) 或 FASTA (本地对齐),这些方法比搜索和分析数据库的不同区域更快,以确定两个序列之间的类似性.这些方法比搜索和分析数据库的不同区域更高.这些方法会更快地确定两个序列之间的类似性.这些方法比搜索和分析数据库的不同区域更高.