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bpRNA_CRW_2852 | CCCCGACUCUGGGAUAACUGCUAGAAAUGGUAGCUAAUACCGGAUAUGACGAUUGGCCGCAUGGUUCUGGUGUGGAAAGAAUUUCGGUUGGGGAUGGACUCGCGGCCUAUCAGGUUGUUGGUGAGGUAAUGGCUCACCAAGCCUACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGACCGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAACGCAUUAAGUUCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCAUGCGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAAGGCUUGACAUAUACCGGAAACGUGCAGAGAUGUGCGCCCCGCAAGGUCGGUAUACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAG | (((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((((((....)))).)))))).....((...)).)))))))............(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..(.((((((....))))...)))......((((..........))))...................(((......((((....))))....)))...............................................((((........))))....................(((((((((..(((((((....))))))).((....)))))))))))....................... | SSSSSSSMSSSSIIIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIIIIISSSSMMMMMSSSSSSSSSSHHHHSSSSBSSSSSSMMMMMSSHHHSSMSSSSSSSXXXXXXXXXXXXSSSBBSISSSBBSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSSSIIIIISSSSXXSBSSSSSSHHHHSSSSBBBSSSXXXXXXSSSSHHHHHHHHHHSSSSXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSSSIIIIIISSSSHHHHSSSSIIIISSSXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSSSSHHHHHHHHSSSSXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSSSSSSSSSMMSSSSSSSHHHHSSSSSSSMSSHHHHSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_7488 | GAGUUUGAUCCUGGCUCAGAACGAACGUUAGCGGCGCGCUUAACACAUGCAAGUCGAGCGAGAAAGGGCUUCGGCCCCGGUACAGCGGCGCACGGGUGAGUAACACGUAGGUAAUCUACCCCCAGGUGGUGGAUAACCUUCCGAAAGGAGGGCUAAUACAGCAUGAGACCACGAUCUCGAAAGGGAAUGGGGUCAAAGCCGGCCUCUUCAUGAAAGCUGGCGCCAGGGGAUGAGCCUGCGGCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAACGGCCUACCAAGGCGAUGAUCCGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCAAUGCCGCGUGAGUGAGGAAGGCCUUAGGGUUGUAAAGCUCUUUCGGCGGGGACGAUGAUGACGGUACCCGCAGAAGAAGCCCCGGC | (((((.......))))).............(((((((((....(((.(((..(((..(((.....((((....))))......))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).............(((....)))............((....................)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).[.(((((((...(.......)....))))))..]).......... | SSSSSHHHHHHHSSSSSMMMMMMMMMMMMMSSSSSSSSSIIIISSSBSSSMMSSSBBSSSIIIIISSSSHHHHSSSSIIIIIISSSSSSMMMMMMSSSMMMMMMSSSSSSSSBBSSIIISSSSSSSMSSSSIIIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIIIIISSSSMMMMMMMMMMMMMSSSHHHHSSSMMMMMMMMMMMMSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSMSSSSSSSIISSSSSSSSSSSSSBBSISSSBBSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSSSIIIIISSSSMMSSSSSSSSHHHHSSSSBBBSSSSSSSMSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSMSSSSHHHHSSSSMMMSSSSSSISMMMMMSBSSSIIISSSSSHHHHSSSSSISSSSMSSBSSSSSSMMSSSSIIIIIISSSSHHHHSSSSIIIIISSSSMMMSSSSSSSIIISHHHHHHHSIIIISSSSSSBBBSEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8497 | UGUGGCGGCGGCCACAGCGGCCGGGGCCACACCCGGGCCACAUCUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCGGCCGCGUCCCGGGUGGUACUGCGCUCCGAGAGGGCGCGGGAAGCCCGGGAUGCCGCCGCCGUCCCCC | ......((((((....((((.((((....(((((((..............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))).......... | EEEEEESSSSSSMMMMSSSSBSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8499 | AUUCCGUAAGUUCGGAUUUGAGGCGGCCAGAGCGGCAGGGAAACACCUGUACCCAUCCCGAACACAGUGGUUAAGUCUGCAAGCGUUGGAGCACGUACUGGAGUGAGAGAUCCUCUGGGAGCGCUUCAUCGCCGCCUUG | .....................((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8504 | UAGUGGCCCGGCCCGGCCAUAGCGGCCGGGUAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCGCGUUGGAGGCUCCAGUGGGGUCCGAGAGGCCCUGCAGGGGCCUCCAAGCCGGGGCCGGGCCACUA | ...........((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))...)))))))))))))............ | EEEEEEEEEEESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8510 | AUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUUUUCU | ...((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..)))))))..................... | EEESSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSXSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8513 | AAUAGCGGCCACAGCAGGUGUGUCACACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGACACCUCACGUGGAUGACGGUACUGAGGUACGCGAGUCCUCGGGAAAUCAUCCUCGCUGCUAUUG | ...((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))).... | EEESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8524 | UCGCGGCCAGGGCGGAGGGGAAACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAGCCCUCCAGCGAACCAGCUAGUACUAGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGCGCUGGUUCGCCGCCACC | .((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))... | ESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8533 | NNUUAGCGGCCAUGGCGGCAGGGUUAACUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCUGCCAGCGUUGUAUACGGUACUAAAGUGCGAGAGCCUUUGGGAACUAUACUCCGCUGCUGAUCAAU | ....((((((....((((((((.....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))....... | EEEESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_8550 | GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU | ...((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))...... | EEESSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSSSMSSSSSSSIIISSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSSSIISSSSSSSMSSSSSSEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_15639 | UCCCUGGUGAAAUUAGCGCUGUGGAACCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGAAGUGAAACGCAGCUGCGCCGAUGGUAGUGUGGCUCAAGCCAUGCGAGAGUAGGUCAUCGCCAGGGGC | ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))). | SSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_15847 | UAGAGGUUUUUAUUAACUUGGUGGUUUUAGCAAAAAUGAAACACCCGAUCCCAUCUCGAAUUCGGAAGUGAAACUUUUUAGCGCUGAUGGUACUUGAAAAGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAAGUUU | ..............((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((....)))..)))))))...)))))))))). | EEEEEEEEEEEEEESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSHHHHSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_15871 | CCCGGUGGCUAUCGCGGAGGGGCCACACCCGUUCCCUUUCCGAAUACGGUCGUUAAGCCCUCCAGCGCUGAUGGUACUGCUUCGGAGACGAGGUGGGAGAGUAGGACGUCGCCGGGUUAUU | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...))))))))..... | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_15994 | UUUGCGGUGGUCAUAGCCCUGGUGAGACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGUAGCUAAGGCCAGGCGCGGCGAUGGUACUGCACUCGAGAGGGUGUGGGAGAGUAGCACGCCGCCGC | ...(((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...))))))) | EEESSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16021 | AGCUUGACGAAUAUAGUUUGUGGGACCAACCUGAAACCAUUCCGAACUCAGAAGUUAAAUCACCUAACGCCUAUGGUAGUAUGAGGUUCUCCUCAUGUGAGAGUAGGUUAUCGUCAGGCUA | ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))))). | SSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16023 | GUUUCCCGGUGGUUAUAGGGGCAGGGUUCCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCUGCCACCGCCGAUGGUACUGCAUGCGCAGGUGUGUGGGAGAGUAGGUCACUGCCGGGA | ...(((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...))))))))) | EEESSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16024 | AUUUUGUCGGCAGGGUCACACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCCUGCUGGAGCCGAUGGUACUGCGCGGGUAACUGUGUGGGAGAGUAGGAAGUCGCCGGGAUUAUUAUA | (.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)................ | SMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16029 | UCCGGCGACUAUAGCAUAGGGGCAACACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGCAGUUAAGUCCUAUCGCGCCGAUGAUAUUGCGCGGGAGACUAGCGUGAGAAAGUAGGUCAUCGCCGGG | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....)).))))))..)))))))...)))))))) | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSBSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16032 | UGGCGGACAUAGCGAAUUGGACCCACUCCUUUCCAUUCCGAACAGGACAGUGAAACGAUUCUGCGCCGAUGAUAGUGUAGUCUUUUCUACGCGAACGUAGGACACUGCCAGGCU | ((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((......))))))..)))))))...)))))).... | SSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSHHHHHHSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16084 | UUCGGUGGUCAUAGCGUGAGGGAAACGCCCGGUUACAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGCCUUACAGCGCCGAUGGUACUGCAGGGGGGACCCUGUGGGAGAGUAGGACGCCGCCGAACAAAUUUUAG | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))).......... | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16113 | GGCCUGGUGGUUUUAGCGAAGAGCCUCAACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUUAAACUCUUCAGCGCCAAUGGUACUAUGGCUUAAGCCCUGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGCCU | ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))). | SSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16119 | AAACUUGGUGGCAUUAGCGCGAUAGUACCACCUGAUGACCAUUCCGAACUCAGAAGUGAAAUGUCGUGGUACCGAUGGUAGUGUGAGGAUUCCUCAUGUGAGAGUAGGGGGCUGCCAAGUUU | .((((((((((.....((((((((....(((((((..............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))))). | ESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16146 | GUUUGGUGGCAUUAGAGAAAGGGAAAUACCUGAACCCAUUCCGAACUCAGAAGUCAAGCCUUUCAUCGCCGAUGGUACUGCACACAAGAGUGUGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAAACU | (((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((.(..(((.((((....)))))))..))))))...))))))))). | SSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSBSIISSSBSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSMMMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16221 | UUCUUGACGACCAUAGAACAUUGGAACCACCUGAUCCCAUCCCGAACUCAGCAGUGAAACGAUGUAUCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUUUCCCCAUGUGAGAGUAGGUCAUCGUCAAGAUU | ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))))). | SSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16263 | ACGCUUGGUGGUCAUAGCACUUUGGACCCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGGUCGUGAAACGAAGUCGCGCCGAUGAUAGUGUGUUUUCACAUGCGAAAGUAGGUCACUGCCAGGCAC | .((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((....))))))..)))))))...)))))))))). | ESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSHHHHSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16264 | CUUGGGGACAAUAGCAAGAUGGAACCACCUGAUCCCUUUCCGAACUCAGAAGUGAAACGUCUUAGCGCCGAUGGUAGUGUGUCAGGUGGCAUGUGAGAGUAGGUCAUCCCCAAGC | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16283 | CUAGGUGGCUAUAGAGAGAGGGAAACGCCUGGUCCCAUUCCGAACCCAGAAGCUAAGCCUCUCAUCGCUGAUAAUACUGAUCCUUGCAGGAUUGGAAAUGUAGGUCGCUGCCUAGU | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16292 | CGACCUGGUGGUAAUGGCAGGGGGUCCCCACCGGAUCCCAUCCCGAACUCCGUCGUUAAGCCCCCUUGCGCCGAUGGUACUACGUCUUAAGGCGUGGGAGAGUAGGUCGCUGCCGGGUC | .((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))) | ESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16293 | CUGGUGGCUAUAGCGCGGGGGAAACACCUCUUCUCAUUUCGAACAGAGAAGUUAAGUCCCGCAGCGCCGAUGGUACUGGCCGUUGGCCGGUAGAGUAGGACGUUGCCAGG | (((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((...))))))..)))))))...))))))). | SSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSHHHSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16299 | CUAGUGAUAAUAGCGAAAGUGAAACACUCGACUCCAUUCCGAACUCGAAAGUGAAACCUUUUUGCGCCGAUGGUACUGCUUGUGUGGGAGAGUAGGUGGUUGCUAGGUCC | (((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((....))))..)))))))...))))))).... | SSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSHHHHSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16389 | GCCGGUGAUCAUACCGCGUGGGAAACACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCCACGCUGGGCCGAUUGUACUGCACGCGAAAGUGUGUGGGAGAGUAGGUCGUCGCCGACA | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16478 | CUGGGUGACCUUAGCGAGGAGGACCCACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGUAGUUAAGCUCCUCAGCCCCAAUGGUACUGCACGCGCAAGUGUGUGGGAGAGUAGGACGUCGCCCGGU | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16481 | GGCGGCGGUAAGAGCGAGGAGGAAACACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGUCGUUAAGCUCCUCUGCGCCGAUGGUACUGCGCGGGAAGCUGCGUGGGAGAGUAGGGCAUCGCCGCCC | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16541 | CCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUCGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCUCUUACAGCCCAAACCGCCC | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((....))))))..)))))))...))))))))..................... | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSHHHHSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16548 | UCUGGUGGCAAUAACGAGAAGGAAACACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGUAGUUAAGCUUCUCAGUGCCGAUGAUACUAGGAUGGAGACGUCCUGGGAAAGUAGGUCGCUGCCAGAU | ((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))). | SSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16579 | UUUGUCGGUGGUUGUUAGCGGUGGGGUCACGCCCGGUCCCUUUCCGAACCCGGAAGCUAAGCCUACCUGCGCUGAUGGUACUGCACCUGGGAGGGUGUGGGAGAGUAAGUCACCGCCGAC | ...((((((((......((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))) | EEESSSSSSSSMMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16582 | UGCUUGGUAACAAUAGCGUUUUGGACCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGUAGUGAAACGAAACAGCGCCGAUGAUAGUGUAGCAUUUGCUAUGUGAAAGUAGGACAUUGCCAGGC | .(((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...))))))))) | ESSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16610 | AAAGUUUGUAUUGCUAGCUUGGUGGUUAUAGCAUGAGUGAAACACACGAUCCCAUCCCGA | ............................................................ | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16617 | UUUGGCGAUAAUAGCUUGUAGGAACCACCUGAUCCCAUUCCGAACUCAGAAGUGAAACUACAAUAGCGCCGAUGAUAGUCUGGCAAUGCCCAGUAA | .............((((((((....(((((((.............))))..)))...))))))..)).......(..((.((((...).))))).) | EEEEEEEEEEEEESSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBBSSXXXXXXXSIISSBSSSSHHHSBSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16655 | GGACCUGGUGGCCAUUGCGAGGGCCCUACACCCGAUCCCUUCCCGAACUCGGCCGUGAAAUCCCUCAGCGCCUAUGAUACUGCACCUCAAGGUGCGGAAAAGUCGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))). | ESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16680 | CCGGCGGCCUGAGCGGUGUGCCAGAACCCGAUCCCAUCUCGAACUCGGCCGUUAAACACACCAGCGCCCAUGGUACUGUGCUCCAAGACACGGGAGAGUCGGUCGCCGCCAGGCU | (((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...))))).)).. | SSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSBSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16709 | UUCCGGUGGUGAUAUCAAGAAGGCUACACCCGAUCCCAUACCGAACUCGGAAGUUAAGCUUCUUGGAGCCGAUGGUACUGCCAGGGCAACCUGGUGGGAGAGUAGGACGCCGCCGGGAC | (((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...))))))))). | SSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16767 | UCCUCGGGACCAUAGCGGAGGGGAAACACCCGGUUUCCAUUCCGAACCCGGCAGUUAAGCCCUCCAGCGCCGAUGAUACUGUGCCGGGCGAACGGCACGGGAAAGUAGGUCGUCCCGGGGGUU | (((((((((.....((((((((....(((((((..............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((......))))))))..)))))))...))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16771 | UGGUUGGUGAUUACAGAGAAAAGGUCACACUCAGCUCCAUUUCGAACCUGAAAGUUAAGCUUUUCUUCGUCGAUAAUACUGCCCCCUACGGGGGUGGGACGGUAGAUCGUUGCCAACCAU | ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))))). | SSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSSHHHSSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16799 | UUGCUUGGUGGCUAUAGCGUCUGUGACCCACCCGAUCCCAUCUCGAACUCGGCCGUGAAACCGGACUGCGCCGAUGGUACUAGUGCUUCAAGCACUGGAAGAGUAGGUCGUCGCCAGGCAU | .((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((.....)))))))..)))))))...)))))))))). | ESSSSSSSSSSMMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSSSIISSSSSSSHHHHHSSSSSSSIISSSSSSSMMMSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_16874 | UCCUGGCGACCAUAGCUGUUUGGUACCACCUGAUACCUUUCCGAACUCAGUAGUGAAACAAACACGCGCUGAUGAUAGUGUGGGGUCUCCCC | ..............((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).))..............((((...)))) | EEEEEEEEEEEEEESSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSXXXXXXXXXXXXXXSSSSHHHSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_17850 | UGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCCUUUUCACAGAAUUUUUC | ......................................... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_17885 | UGUAGGUACUGGAACAGCGAAAACGGCUGGCAAUACCAGGUGCUGUAGGCGUUUUC | ((......(((((..(((....)))))))).....))................... | SSIIIIIISSSSSBBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_17927 | GACUACAGUCCCAUACCACCCUGAAAGUGCUCAAUCUGGUCUGAUUUCGGAAGUUAAGCAGGGUCGGGCUUGGUCAGUACUUAGAUGGAAGA | ...............((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).))......................... | EEEEEEEEEEEEEEESSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_17929 | UUACAGCCAUACCACCCUGAACUUGGAAGCUAAGCAGGGUUGGGUCUGGUUAGCACUUGGAAGGGAGG | ...(((((((............))))..)))..................................... | EEESSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_17940 | GUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACACACCCGACCUUAUCUGAUCUUGGAAGCUCGACAGGGUCAGGCCUGAUUAAUACUUGGAUGGGAAA | .............((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).))......................... | EEEEEEEEEEEEESSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18254 | GCUUAGCGUCAUACCGCGUAGAAUAAACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUCAAACUACGACGGGCGGGGUUAGUACUUACAUGGGUGACCGGUUGGGAAUACCUCGUGCGCUAAGCAUUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18445 | GCCUGCGGCCACACAACCUUGAAUAAGCCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAACGUUGGGCUUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCACCUGGGAAUAUCAAGUGCUGUAGGCAUU | (((((((((....((((((((....(((((((..))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18524 | GUAGACGGCCAUCUUAGGCUGAAAGCACCGUAUCCCGUCUGCUCUGCGAAGUUAAGCAGCCUCAAGCUCGGGUAGUACUCGGGUGGGUGACCACCGGGGAAGUCCGGGUGCUGUCUACUUUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18529 | GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCCCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU | (((((((((....................................))))))))).. | SSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18570 | GACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGUAU | .(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | ESSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18575 | AGGUGCGACCAUACCGUGUUGAAAAUUCUGCAUCCCGUCCGAUCUGCAAAGACAAGCAACACAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGUGACCACGUGCGAAUACUGUGGUGUUGCACUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....)))))..))))))))) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18842 | GAGUACGACCAUACUUGAGUGAAAGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCACCCACAGGCUUAGUUAGUACUGAGGUCAGUGAUGACUCGGGAACCCUGAGUGCCGUACUCCCAACUUCUUUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))............. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_18870 | GUCUACAGCCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUNNNCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGAGCUUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGUCGUAGACUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19000 | ACAUACGACCAAAGCUCGUAGAGAAUACGGGGUCCCGUCCGCUCCCCCAUCGUCAAGCUGCGAAGCGCUGGAUUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUCCCCAGUGUUGUAUGU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19063 | AAGCUACGGCCAUAUAAUACCGAAAGCACCGGAUCCCGUCCGAUCUCCGCAGUUAAACGGUAUAUAGAUCAGUCAGUACUAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUACUGGUUGCUGUAGUUU | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).) | SISSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19096 | AGGAACGGCCAUACCACGCCGAUCGCACCAUAUCCCGUCCGCUCUGUGAAGUUAAGCGGCGUCGGGCCAGGCUAGUACUACGGUGGGGGACCACGUGGGAAGCCCUGGUGCUGUUCCU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19097 | UUCUGUACGGUCAUACCUGGUUGGAAACGGCGGAUCCCGUCCGAUCUCCGAAGCUAAGCAACCAUGGGCGUGUCUAGUACUCAGGUGGGGGACCACUGGGGAAGCGCNNNACGUACUGUACAGC | ..(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))...))).))))))))). | EESSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSBBBSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19098 | AUGGUCGUUCAUACUAGCACUACUGCACCCUAACCCGUCAGAUCUAGGAAGUUAAGCGUGCUCAGGCGAGGCCAGUAGUACGGUGGGUGACCACGUGCGAAGCCCUCGUGACGAUCGU | (.(((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))).) | SISSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19104 | GGUUGCGGCCAUAUCAAGUGGAAAAUACUGUUUCCUGUCCGAUCAACGUUAGUCAAGCCACUUAGAGCCACAGCGAGUAAUGCAGUUGGAGACAAUGCGUGAAAUUGUGGUGCUGCAAUCUUUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((.......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19108 | ACAUACGACCAUAGACAGCUGAAAAUACGGCAUCCCGUCCGCUCUGCCCGAGUCAAACAGCUGAUCGCCAGACUAGUACUCAGGUGGGUGACCACUGGGGAAUCCCUGGUGUUGUAUGUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19109 | AGCUGGGGCCAUAUGAACCUAUAAGUACCGCAUCCCGUCCCGAUCUGCGAAGUCAAGCAGGUUACAGCUCGGUUAGUACUAUGAUGGGAGACCACAUGGGAAUACCGGGUGUCCCAGCUU | (((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSBS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19118 | GCAAUCGGCCAUACUACAUCGAAUAUACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGUCAAGCGGUGUAAGGUUCGGUUAGUACUAGGGUGGGGGACCACCUGGGAAGACCAGAAUGUCGAUCGCCUCCC | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....)).))).)))))))))..... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSBSSSMSSSSSSSSSEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19131 | AAGUUACGGCCACAUCAUCGUGAAAAGACCAAAUCCCGUCCGAUCUUUGCAGUCAAACACGAUCGAGCUUCGUCAGUACUAUGGUGAGAGAUCACAUGGGAAUACGAAGUGCUGUAAUUU | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).) | SISSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19132 | GUGUACGGCUAUACUACCGGAAAAGCGCCCGUUCCCGUCCGAUUACGAGAGCCUAGCCCGGUCAGGCCCGACUAGUACUAGGGUGGGGGACCACCUGGGAACAUCGGGUGCUGUACACU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19137 | GUAUACGGCCAUACUAGGUUGGAAACACAUCAUCCCGUUCGAUCUGAUAAGUAAAUCGACCUCAGGCCUUCCAAGUACUCUGGUUGGAGACAACAGGGGAACAUAGGGUGCUGUAUACU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19141 | GUACGAUCAUACUUGGCCGUAAGCACCCGUUCUCAGCCGACCACGGAAGUUAAGCGGUUAUAGGCUGUGUUAGUACUUGGCUGGGUGACCGCCUGGGAACUCACAGUGUCGUACUU | (((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))).. | SSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19191 | GCUUACGGCCAUACCAGCCUGAAUACGCCCGAUCUCGUCCGAUCUCGGAUCCCAAGCAGGUAAGGGCCUGGUCAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGAAAUAUCAGGUGCUGUAAGCUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19472 | GUCGACGCUCAUACUAGGUUGGGUCCACCCGAUCUCGUUCGAUCUCGGCAGUUAAACAACCUUAGGCCUCGUUAGUACUUGAAUGCGUGAGCGUCUGGGAAUACGAGGUGGUGUCGACUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19481 | GAUUACGGCCAUAUCCACGGAAAAGCACCGGAACUCGUCAGAUCUCCGAAGUUAAGCCCGUGCGAGCCUGGGUAGUACUGAGAAGGGAGACCGCUCGGGAAUACCGGGUGCCGUAAUCUU | .((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))... | ESSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19693 | GCUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAUGCACCGGAUCCCAUCCGAACUCCGAAGUUAAGCGGUUUAAGGCCUGUUAAGUACUGAGGUGGGGGACCACUCGGGAACUUCAGGUGCUGAUAGCUUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))... | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19718 | ACAUUCGGCCAUAUCAAGUUGACAAACGCCGUAUCCCAUCCCGAACUACGAAGCUAAGUCACUUUGAGCUGGGCUAGUACUGAGAUGAGGGAUCGGUCUGGAAUCCCCAGUGCUGUAUGUU | (((((((((....(((((.(((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SSSSSSSSSMMMMSSSSSBSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19732 | GUAUACGGUCAUACCCGUGGCACACGCAGGCGAACCCAUCUCGAAUUCGCAACUUAAGCGCACGUGGGCUUGGUCAGUACUGGGGUGAGGGAUCACCCGGGAACCCCAAGUGCCGUAUGC | (((((((((....((((((((.....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19740 | AUCUACGGCCAUACCACAUUGAGAGCACCCGAUCUCGUUCGAUCUCGGAAGUUAAGCAAUGUAGGGAUCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGUUGCUGUAGAAA | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19803 | AUCCACGGCCAUAGGACACAGAAAACAUCGCAUCCCGUCCGAUCUGCGCAAUCAAGCUGUGUACCGCCCAGUCAGUACCGGAGUGGGGGACCAUCCGGGAAUCCUGCCAGGUGCUGUGGUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....)))...)).))))))))) | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSBBBSSMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19813 | AAAUUACGGCCAUACACAGGAGAAAGCUCCGCAUCCCGUUCGAUCUGCGCAGAUAACCUCCUGAUGGCAGGGUCAGUACUAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUACCCUGUGCUGUAAUUU | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).) | SISSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19840 | ACAUACGACCAUACCCACUGGAAAACUCGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGAUAAGCCAGUGAGGGCCAGACUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUCCCUGGUGUUGUAUGUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19848 | AUGGUACGGUCAUACCACGGCUAAUGCGCCCGAUCCCAUCCGAACUCGGAAGCCAAGCGCCGUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCCGGUGCUGUACCUAU | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SBSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19850 | GAUACGGCCAUAUCUACUGAAAACCACCGGAACCCAUCAGAACUCCGAAGUUAAACCAGUAUGAGCUUAAUUAGUACUAAGAAGGGAGACCACUUGGGAACGUUGGGUGCUGUAUUU | ((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))). | SSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19918 | GUGAUGCGUUCAUACUACUUCGAAAGCACCCGAUCCCAUCAGAACUCGGAAGUUAAGCGGAGUUAGGCCGGUCUAGUACUGAGUUGAGUGAUCACUCGGGAAUCACCGGUGACGCAUUGC | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | SBSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19922 | AAUCUACGGCCAUACAGAUAGUAACACACCGGAUCCCGUCUGAUCUCCGCAGUUAAGUCUCUCCUGGUAGCGUCAGUACUAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUACGCUAUGUCGUAGGUU | (.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).) | SISSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_CRW_19929 | GGAUGCGGCCAUACUAAGGAGAAAGCACCUCAUCCCGUCCGAUCUGAGAAGUUAAGCUCCUUCAGGCGUGGUUAGUACUGGGGUGGGGGACCACCUGGGAAUCCCACGUGCUGCAUUCUU | (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).. | SSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSIIIISSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSBBSSSIIISSSSSSBSSMSSSSSIIIIIISSSSSBSSSHHHHSSSSSSSSIIIIISSSSSMSSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA-spot
bpRNA-spot is a database of single molecule secondary structures annotated using bpRNA.
bpRNA-spot is a subset of bpRNA-1m. It applies CD-HIT (CD-HIT-EST) to remove sequences with more than 80% sequence similarity from bpRNA-1m. It further randomly splits the remaining sequences into training, validation, and test sets with a ratio of apprxiately 8:1:1.
Disclaimer
This is an UNOFFICIAL release of the bpRNA-spot by Jaswinder Singh, Jack Hanson, Kuldip Paliwal and Yaoqi Zhou.
The team releasing bpRNA-spot did not write this dataset card for this dataset so this dataset card has been written by the MultiMolecule team.
Related Datasets
- bpRNA-1m: A database of single molecule secondary structures annotated using bpRNA.
- bpRNA-new: A dataset of newly discovered RNA families from Rfam 14.2, designed for cross-family validation to assess generalization capability.
License
This dataset is licensed under the AGPL-3.0 License.
SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0-or-later
Citation
@article{singh2019rna,
author = {Singh, Jaswinder and Hanson, Jack and Paliwal, Kuldip and Zhou, Yaoqi},
journal = {Nature Communications},
month = nov,
number = 1,
pages = {5407},
publisher = {Springer Science and Business Media LLC},
title = {{RNA} secondary structure prediction using an ensemble of two-dimensional deep neural networks and transfer learning},
volume = 10,
year = 2019
}
@article{darty2009varna,
author = {Darty, K{\'e}vin and Denise, Alain and Ponty, Yann},
journal = {Bioinformatics},
month = aug,
number = 15,
pages = {1974--1975},
publisher = {Oxford University Press (OUP)},
title = {{VARNA}: Interactive drawing and editing of the {RNA} secondary structure},
volume = 25,
year = 2009
}
@article{berman2000protein,
author = {Berman, H M and Westbrook, J and Feng, Z and Gilliland, G and Bhat, T N and Weissig, H and Shindyalov, I N and Bourne, P E},
journal = {Nucleic Acids Research},
month = jan,
number = 1,
pages = {235--242},
publisher = {Oxford University Press (OUP)},
title = {The Protein Data Bank},
volume = 28,
year = 2000
}
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