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yum list installedで表示されるパッケージは全てユーザが手動で追加したものなのでしょうか。  
それともシステムが自動でインストールしたパッケージも含まれているのでしょうか。  
また、ミドルウェア・アプリケーション単位で関連するパッケージをツリー形式で表示するなどの方法はありますでしょうか。
CC BY-SA 4.0
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question
yum
yum list installedについて
既にご存じかとも思いますが、`yum`
コマンドではパッケージの依存関係を解決して足りないパッケージを追加インストールするので、自分自身がコマンドで指定したパッケージ以外にもインストールされているケースがままあります。

`yum list installed` で表示されるのは **今現在システムにインストールされているパッケージ一覧** と考えてください。

「関連するパッケージをツリー表示」も、標準のコマンドでは出来ないと思います。
CC BY-SA 4.0
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answer