OSはYosemiteです。  
railsに関するコマンドを入力すると

```

    Could not find nokogiri-1.6.5 in any of the sources
    Run `bundle install` to install missing gems.
    
```

と出るので、bundle installを行うと、libiconv, libxml2 is missingのエラーが置きます。

```

    gem install nokogiri
    
```

はうまくいきインストールされるのですが、bundle installが出来ません。

```

    checking if the C compiler accepts -Wno-error=unused-command-line-argument-hard-error-in-future... no
    Building nokogiri using system libraries.
    checking for xmlParseDoc() in libxml/parser.h... no
    checking for xmlParseDoc() in -lxml2... no
    checking for xmlParseDoc() in -llibxml2... no
    -----
    libxml2 is missing.  Please locate mkmf.log to investigate how it is failing.
    -----
    *** extconf.rb failed ***
    Could not create Makefile due to some reason, probably lack of necessary
    libraries and/or headers.  Check the mkmf.log file for more details.  You may need configuration options.
    ................................................
    ................................................
    An error occurred while installing nokogiri (1.6.5), and Bundler cannot continue.
    Make sure that `gem install nokogiri -v '1.6.5'` succeeds before bundling.
    
```

コマンドラインツールスもインストールして、libiconv, libxml2もそれぞれインストールして、brew linkも行いました。  
何が原因か分からず、１週間ほどこのエラーに悩んでいます。
CC BY-SA 3.0
2015-04-04T17:45:17.573
8769
2017-01-30T04:42:25.063
2017-01-30T04:42:25.063
20446
9166
question
ruby-on-rails macos
Yosemiteで、bundle installを行うと、nokogiri install時にlibxml2 is missingのエラー
エラーログを見ると、Bundlerで必要なのは 1.6.5 のようです。

`gem install nokogiri`すると最新のgemを取ってくるので1.6.5がインストールされないのではないでしょうか？

エラーログにもあるように`gem install nokogiri -v '1.6.5'`とバージョンを指定してインストールしてみてください。

（ちなみに`gem search nokogiri -l`でインストールされているnokogiriのバージョンが確認できます。）

で、おそらく`gem install nokogiri -v '1.6.5'`しても同じようなエラーが出ると思います。

僕の場合、nokogiriをインストールする場合はこんなオプションを付けてインストールします。

```

    gem install nokogiri -v '1.6.5' -- --use-system-libraries
    
```

これでもダメならネットの各種情報をあたってみてください。

たとえばQiitaにもたくさんnokogiri installに関する情報が載ってます。

[http://qiita.com/search?utf8=%E2%9C%93&sort=rel&q=nokogiri+install+libxml2+is+missing&sort=rel](http://qiita.com/search?utf8=%E2%9C%93&sort=rel&q=nokogiri+install+libxml2+is+missing&sort=rel)

他にも「nokogiri yosemite 1.6.5 libxml2 is missing」のようなキーワードでネットを検索してみてください。
CC BY-SA 3.0
2015-04-05T05:50:56.257
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2015-04-05T05:50:56.257
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8769
answer
You need to install missing development dependencies by:

```

    xcode-select --install
    
```

See: [gem install nokogiri -v '1.6.8.1'
fails](https://stackoverflow.com/q/39937394/55075)

For Ubuntu, see: [nokogiri failing to
upgrade](https://stackoverflow.com/q/30425210/55075).
CC BY-SA 3.0
2017-01-30T04:09:07.847
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2017-01-30T04:09:07.847
2017-05-23T12:38:56.083
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answer